stage : Modélisation mathématique de l’épidémie du VIH chez les HSH nés en France - réf. DMI-STA-2026-01

Sujet du stage :

En France, comme à l’échelle mondiale, l’épidémie du VIH/sida se poursuit quarante ans après la découverte du virus. La Stratégie nationale en santé sexuelle a fixé comme objectif de mettre fin à cette épidémie en tant que menace pour la santé publique d’ici 2030. Chez les hommes ayant des relations sexuelles avec des hommes (HSH) nés en France – une population particulièrement touchée - l’incidence du VIH se stabilise depuis 2021 après plusieurs années de baisse. Les causes de ce changement de tendance préoccupant ne sont pas encore bien comprises. 

Les dynamiques de l’épidémie du VIH sont complexes : les délais entre contamination et diagnostic sont souvent longs et rarement connus, et les perturbations du système épidémiologique peuvent engendrer des effets non-linéaires. La modélisation mathématique vise à traduire les mécanismes de l’épidémie (transmission, diagnostic, mise sous traitement, …) en équations, afin de mieux les appréhender. Elle permet notamment d’estimer des paramètres, de faire des projections, et de simuler des scénarios pour l’avenir. Elle permet aussi de décrire et de prédire des indicateurs clés comme l’incidence, la prévalence, et la taille de la population non diagnostiquée.

Des modèles mathématiques ont déjà été développés pour étudier la transmission du VIH dans d’autres pays à revenu élevé, comme le Royaume-Uni, les Pays-Bas et les Etats-Unis 1-4. Cependant, Santé publique France ne dispose pas encore de modèle de transmission du VIH en France.  Le développement d’un tel model est une priorité pour SpF et ce stage est une étape préliminaire, avec un focus sur les HSH nés en France pour mieux comprendre les dynamiques de l’épidémie dans cette population.

1.  Cambiano V, Miners A, Lampe FC, et al. The effect of combination prevention strategies on HIV incidence among gay and bisexual men who have sex with men in the UK: a model-based analysis. Lancet HIV 2023; 10: e713-e722. 2023/11/06. DOI: 10.1016/s2352-3018(23)00204-7.

2. De Bellis A, Willemsen MS, Guzzetta G, et al. Model-based evaluation of the impact of a potential HIV cure on HIV transmission dynamics. Nat Commun 2025; 16: 3527. 2025/04/23. DOI: 10.1038/s41467-025-58657-x.

3. Khurana N, Yaylali E, Farnham PG, et al. Impact of Improved HIV Care and Treatment on PrEP Effectiveness in the United States, 2016-2020. J Acquir Immune Defic Syndr 2018; 78: 399-405. 2018/04/24. DOI: 10.1097/qai.0000000000001707.

4. Shah M, Risher K, Berry SA, et al. The Epidemiologic and Economic Impact of Improving HIV Testing, Linkage, and Retention in Care in the United States. Clin Infect Dis 2016; 62: 220-229. 2015/09/13. DOI: 10.1093/cid/civ801.

Missions du stage :  Contribuer à la compréhension des dynamiques épidémiologiques du VIH chez les HSH nés en France à travers une approche de modélisation mathématique

Activités du stage : 

• Réaliser une revue de la littérature des modèles mathématiques de la transmission du VIH dans des pays à revenu élevé
  • Choisir une approche de modélisation adaptée à la situation épidémique en France
  • Implémenter sous R (ou un autre langage adapté) un sous-ensemble de ce modèle axé sur les HSH nés en France, avec des paramètres adaptés
  • Calibrer les principaux paramètres de transmission aux données de surveillance du VIH en France 

Objectif du stage : L’objectif du stage est d’identifier et d’appliquer un modèle mathématique pour décrire le dynamique de l’épidémie du VIH chez les HSH nés en France

Profil recherché

Master 2 Professionnel

Master 2 Recherche

Prérequis : 

Compétences spécifiques :
Statistiques appliquées niveau Bac+5 (ou épidémiologie avec des compétences en statistique)
Capacité à s’approprier de nouvelles méthodes statistiques non enseignées
Motivation à interagir avec les différents acteurs du stage
Rigueur, autonomie, organisation, prise d’initiatives
Maîtrise d’un logiciel spécifique : Maitrise de R, python, ou autre langage adapté indispensable

L’employeur

Santé publique France est l’agence nationale de santé publique française. Etablissement public de l’Etat sous tutelle du ministre chargé de la santé créé par l’ordonnance 2016-246 du 15 avril 2016, elle intervient au service de la santé des populations. Agence scientifique et d’expertise du champ sanitaire, elle a pour missions : 

1° L'observation épidémiologique et la surveillance de l'état de santé des populations ;

2° La veille sur les risques sanitaires menaçant les populations ; 

3° La promotion de la santé et la réduction des risques pour la santé ; 

4° Le développement de la prévention et de l'éducation pour la santé ; 

5° La préparation et la réponse aux menaces, alertes et crises sanitaires ; 

6° Le lancement de l'alerte sanitaire.

L’agence est organisée autour de 12 directions scientifiques, transversales ou assurant le soutien à l’activité. 

Les orientations stratégiques de l’agence et son programme de travail, arrêtés par son Conseil d’administration, se déclinent en trois axes :  Consolider la capacité d’anticipation et de réponse réactive pour faire face aux menaces sanitaires ; Mesurer et évaluer l’ampleur des maladies et des facteurs de risques pour guider leur prévention et leur contrôle ; Renforcer l’impact sur la santé dans toutes les politiques publiques et la prévention et promotion de la santé.

Le siège de l’agence est situé à Saint-Maurice (94). L’agence dispose d’implantations régionales auprès des agences régionales de la santé.