stage : Analyse descriptive de la base nationale du dépistage organisé du cancer du sein, années 2021-2024 - réf. DMNTT-STA-2026-08

Sujet du stage :

Le programme national de dépistage organisé par mammographie a été mis en place en France dans l’objectif de réduire la mortalité par cancer du sein. Il a été généralisé à l’ensemble du territoire en 2004. Il comprend un examen clinique, deux mammographies par sein interprétées en première lecture, un bilan de diagnostic immédiat si nécessaire, ainsi qu’une deuxième lecture systématique en cas d’examen normal. Les femmes de 50 à 74 ans sont invitées tous les deux ans à réaliser ce dépistage. 

Tous les deux ans, Santé publique France collige les données régionales issues des Centre Régionaux de Dépistage des Cancers pour créer une base de données nationale des dépistages organisés du cancer du sein. Cette base regroupe, pour toutes les femmes qui ont effectué un dépistage dans le cadre du programme, leurs caractéristiques individuelles et l’ensemble du parcours et résultats de leurs dépistages. 

Environ 80 variables concernant 2,5 millions de femmes dépistées chaque année sont collectées à chaque remontée de données. La dernière collecte concerne les années 2023 et 2024, avec des mises à jour pour les années 2019, 2020, 2021 et, 2022. Des évolutions récentes ont été apportées dans la construction de cette base de données : 

-une vingtaine de variables supplémentaires ont été collectées pour la première fois pour les années 2021 à 2024. 

-un indice de défavorisation social et un code géographique « EPCI - Établissement public de coopération intercommunale » ont été ajoutés à cette base de données.

L’objectif de ce stage est d’une part de décrire la qualité et la complétude de l’ensemble des données de la période 2019-2024 en utilisant un outil de visualisation récemment développé sous R-Shiny et d’autre part de produire et/ou mettre à jour de nouveaux indicateurs de performance du programme de dépistage, en les déclinant lorsque possible à l’échelle de l’EPCI.   

Missions du stage :

Le stagiaire devra fournir des résultats descriptifs des variables de la base nationale des dépistages du cancer du sein de la période 2019-2024, en déclinant les résultats en fonction de l’âge, des éditeurs de logiciel, et de la région, puis au sein de chaque région, des départements et de l’EPCI. 

Activités du stage : 

En utilisant le logiciel SAS et le logiciel R, le stagiaire mettra en œuvre des statistiques descriptives, fournira des représentations graphiques et si possible cartographiques. 

Profil recherché

-Master 1

-Master 1 + sujet tutoré

-Compétences spécifiques : Bases en statistique descriptive

-Maîtrise d’un logiciel spécifique : logiciel de statistiques (SAS ou R) : SAS et R (R-Shiny). La connaissance d’un logiciel cartographique serait un plus.

L’employeur

Santé publique France est l’agence nationale de santé publique française. Etablissement public de l’Etat sous tutelle du ministre chargé de la santé créé par l’ordonnance 2016-246 du 15 avril 2016, elle intervient au service de la santé des populations. Agence scientifique et d’expertise du champ sanitaire, elle a pour missions : 

1° L'observation épidémiologique et la surveillance de l'état de santé des populations ;

2° La veille sur les risques sanitaires menaçant les populations ; 

3° La promotion de la santé et la réduction des risques pour la santé ; 

4° Le développement de la prévention et de l'éducation pour la santé ; 

5° La préparation et la réponse aux menaces, alertes et crises sanitaires ; 

6° Le lancement de l'alerte sanitaire.

L’agence est organisée autour de 12 directions scientifiques, transversales ou assurant le soutien à l’activité. 

Les orientations stratégiques de l’agence et son programme de travail, arrêtés par son Conseil d’administration, se déclinent en trois axes :  Consolider la capacité d’anticipation et de réponse réactive pour faire face aux menaces sanitaires ; Mesurer et évaluer l’ampleur des maladies et des facteurs de risques pour guider leur prévention et leur contrôle ; Renforcer l’impact sur la santé dans toutes les politiques publiques et la prévention et promotion de la santé.

Le siège de l’agence est situé à Saint-Maurice (94). L’agence dispose d’implantations régionales auprès des agences régionales de la santé.