Ingénieur de recherche en bio-informatique (H/F)

Mission

Dans l'équipe Infections Persistantes et Inflammation Chronique (IPIC) du Laboratoire Interdisciplinaire pour l'Innovation et la recherche en Santé Orléanais (LI2RSO) de l'Université d'Orléans, localisée au CHU d'Orléans, votre mission sera de contribuer à la recherche en bactériologie-virologie par des développements bio-informatiques.

Activités principales

En cohérence avec les orientations stratégiques de l'établissement et pour renforcer son attractivité, vos activités seront les suivantes :

Analyse et traitement des données :

• Analyser les données générées par les activités de séquençage haut débit (Next Generation Sequencinq, NGS) en développant des outils bioinformatiques ajustés à chaque question biologique (génétique des populations, évolution moléculaire, phylogénétique.)

• Définir un plan d'étude et de recueil des données le plus adapté au problème posé

• Interpréter les résultats et avoir le regard critique sur les données générées dans le contexte de la recherche

• Gérer les bases de données, y compris les données de santé et les systèmes d'information pour stocker et partager les données

Développement et maintenance des applications bio-informatique :

• Développer et maintenir les applications bio-informatiques et gérer les outils et les équipements nécessaires

• Assurer la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité

• Participer aux développements bio-informatiques translationnels

• Fournir une expertise informatique et technique

Gestion des projets bio-informatiques :

• Assurer la mise en place, la gestion et la coordination des projets bio-informatiques

• Contribuer à l'obtention de financements de recherche

• Collaborer avec les chercheurs pour intégrer les résultats des analyses dans les projets de recherche

• Participer aux différentes réunions en lien avec l'activité

• Participer à la formation et à l'encadrement d'étudiants et stagiaires (master, doctorants et chercheurs postdoctoraux)

• Assurer la sauvegarde des données

• Réaliser des rapports et des présentations pour communiquer les résultats

• Participer à la rédaction des publications scientifiques