Post-doctorant : Surveillance environnementale H/F (H/F)

Vos missions & activités (liste non exhaustive) L'unité de recherche USC1233-RS2GP est une unité de recherche propre de VetAgro Sup, sous contrat avec l'INRAe. Le projet de l'unité vise la gestion intégrée et personnalisée des rongeurs sauvages à caractère invasif. Son projet s'organise selon 3 axes : un axe dédié à l'évaluation et au développement de solutions de gestion des rongeurs, un autre dédié à l'étude de la dynamique des leptospires et enfin un dernier dédié à l'évaluation et à l'atténuation des risques liés aux rongeurs et à leurs gestions. Vous serez affecté au projet PREZODE-RATSWIM. * Développer une approche innovante de surveillance de la leptospirose en milieu urbain, en croisant analyses des eaux usées, écologie des rongeurs et modèles expérimentaux. * Réaliser des activités de terrain : capture de rongeurs et collecte de prélèvements biologiques pour l'étude des populations urbaines. * Concevoir, optimiser et appliquer des outils de détection moléculaire de Leptospira spp. dans les eaux usées, afin de mesurer la contamination et analyser sa variabilité spatiale et temporelle. * Analyser les liens entre infection des rongeurs et contamination environnementale, pour évaluer la pertinence des eaux usées comme outil de surveillance indirecte et identifier les zones à risque. * Étudier la survie, la persistance et le potentiel infectieux de Leptospira dans les eaux usées, ainsi que l'influence des facteurs environnementaux sur sa transmission. * Mettre en œuvre des modèles cellulaires innovants (cultures 2D/3D, organoïdes) pour évaluer l'infectivité des souches environnementales et animales, dans une approche intégrée One Health. Vos atouts * Formation souhaitée : Doctorat (PhD) en microbiologie, biologie cellulaire/moléculaire, écologie microbienne, ou disciplines connexes. * Solide formation en bactériologie * Expérience ou intérêt pour le travail de terrain en lien avec la capture de rongeurs et les prélèvements biologiques. * Maîtrise des techniques de biologie moléculaire (PCR, qPCR, PCR digitale, extraction d'acides nucléiques à partir de matrices complexes). * Compétences en analyse génomique : analyse de génomes, assemblage et reconstruction de génomes (NGS, métagénomique appréciée). * Expérience dans l'analyse d'échantillons environnementaux (idéalement eaux usées). * Compétences en culture cellulaire 2D ; intérêt ou expérience en modèles 3D/organoïdes. * Capacité à évaluer la viabilité et l'infectivité bactérienne. * Aptitude à concevoir et conduire des protocoles expérimentaux de façon autonome. * Compétences en analyse de données et statistiques de base. * Bonnes capacités de communication scientifique en anglais (écrit et oral). * Goût pour le travail interdisciplinaire et collaboratif. * Rigueur, autonomie et sens de l'organisation. Nous vous offrons : * CDD de 2 ans - Catégorie A (cadre) - Temps plein (38H) * Prise de poste : 01/06/2026 * 50 jours de congés annuels (sur la base d'un temps plein 38H / année complète travaillée) * Travail en semaine avec flexibilité horaire * Télétravail possible en fonction des nécessités de service et après une période d'adaptation * Restauration subventionnée et sur site * Accès aux personnes à mobilité réduite / RQTH * Prime mobilité durable * Activités sportives et culturelles * Prestations sociales Rémunération : selon profil et expérience Pour candidater : CV et LM à envoyer avant le 30/04/2026