Master 2 Bio-Informatique et Biologie des Systèmes

Infinity est un institut de recherche offrant un environnement scientifique centré sur trois axes disciplinaires : l’Immunologie et les Maladies Infectieuses et Inflammatoires. L’institut se compose de 16 équipes de recherche, de 4 plateaux technologiques de pointe et de services supports efficaces (plus de 300 membres au total). Sa localisation au sein du campus hospitalo universitaire de Toulouse Purpan et les liens forts avec de nombreuses disciplines médicales constituent de réels atouts pour la conception et la réalisation d’études à fort potentiel sociétal.

C’est dans cet environnement que le plateau de Génomique et Transcriptomique s’est développé. Le plateau a pour mission d’accompagner les équipes de l’institut dans leurs projets omiques. Il intervient de la mise en place du projet jusqu’à l’analyse de données. 

Les 3 ingénieurs du plateau travaillent sur les différents services : la biologie moléculaires, le traitement et l’analyse de données NGS.

Dans ce cadre, l’apprenti.e sera accueilli.e au sein du plateau et aura pour mission de traiter et analyser des données NGS dans le cadre de projets réalisés par les équipes de l’institut. 

L’apprenti.e aura pour objectifs d’apprendre à :

• Traiter et analyser des données omiques (bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq, scRNA- seq, scTCR-seq…)
• Restituer les résultats d’analyse en adaptant le discours aux différents publics (bio- informaticiens, biologistes, cliniciens...)
• Travailler en suivant une démarche FAIR (traçabilité des analyses, containerisation, dépôt sur bases de données publiques)
• Utiliser une infrastructure HPC pour le traitement des données
• Réaliser une veille bibliographique des outils et techniques omiques

Pour réaliser ces missions, l’apprenti.e sera encadré par la responsable du pôle bio- informatique. Iel interagira avec les membres du plateau pour les aspects techniques, ainsi qu’avec les utilisateurs du plateau pour réaliser les analyses et présenter les résultats.