Ingénieur / Ingénieure de recherche scientifique (H/F)

Mission : Le poste consistera à travailler dans le cadre du projet ANR PHAWET visant à étudier l'effet des perturbations du régime hydrologique des sols sur les interactions entre les hôtes microbiens et leurs virus dans les sols de zones humides. La personne recrutée aura pour missions de : 1) Analyser les données de métagénomique, métatranscriptomique et métaviromique issues du séquençage des communautés microbiennes et virales dans les sols de deux zones humides en Bretagne. 2) Identifier, à partir des données préalablement analysées, des biomarqueurs moléculaires ciblant les taxons dominants et/ou spécifiques à chaque site ou saison ainsi que des associations virus-hôtes microbiens. Activités :

• Analyses bioinformatiques (curation, assemblage et annotation des MAGs et des transcriptomes) des données de séquençage de microorganismes et de virus des sols
• Prédictions d'interactions virus – hôtes microbiens
• Identification de biomarqueurs génétiques correspondant à des microorganismes et virus d'intérêt pour réaliser ultérieurement leur suivi ciblé
• Apporter des conseils méthodologiques et une assistance technique pour la manipulation, l'analyse, le partage et la sauvegarde des données de séquençage
• Effectuer des présentations et des formations afin d'assurer le transfert des connaissances et des compétences aux membres du projet ANR