Ingénieur / Ingénieure de recherche scientifique (H/F)

Mission :

La smart microscopie est un environnement émergent de pilotage dans le domaine de la microscopie. Elle permet de sortir des séquences linéaires d'acquisition en y introduisant de la conditionnalité liée à des apprentissage profonds. Ces nouveaux protocoles expérimentaux sont à créer et on ne voit pas aujourd'hui de limitations à leurs champs d'applications. Les protocoles sont donc à coder et à mutualiser pour faire grandir la pratique de la « smart microscopy ». L' ingénieur recruté travaillera sur la mise en place d'une méthodologie commune permettant des développements de protocoles de smart microscopy en partant de la consultation des besoins émis par les équipes de recherche au sein de 4 instituts (IBDM, CIML, INMED, IMM). Un travail de compréhension de chaque problématique expérimentale sera à réaliser ( en concertation avec les ingénieurs de PICSL) et à traduire dans un nouveau schéma expérimental appelant des bibliothèques sous python dédiées au pilotage des microscopes.

Activités

 Développer des scénarios de smart microscopy sous les différentes interfaces (OAD, JOB, inscoper...) en python

 Ponter les architectures avec des modèles de deeplearning déjà entrainés ou à fine-tuner

 Fédérer un collectif local d'usagers de la smart microscopy

 Former les utilisateurs à la smart-microscopy

 Assurer une veille technologique poussée dans le domaine de la smart microscopy et des solutions open sources