INGÉNIEUR-E BIOLOGISTE EN ANALYSE DE DONNÉES - H/F

Pour ce contrat de travail d'une durée de 2 MOIS RENOUVELABLE, la personne recrutée rejoindra l’équipe « Oncogénèse des sarcomes » dirigée par Frédéric CHIBON.

L’équipe cherche à comprendre les mécanismes chromosomiques de l’oncogenèse des sarcomes pléomorphes, caractérisés par une très grande instabilité chromosomique.

Mission principale

La personne recrutée aura pour missions :

·     D’analyser les données de variants structuraux identifiés par RNAseq sur les données du TCGA

·     D’Evaluer la pertinence du marqueur biologique iTRAC pour l’analyse pronostique et prédictive de la réponse au traitement systémique dans les différents types de cancers analysés par le TCGA

Activités

principales

·     Développer et appliquer des scripts R

·     Développer et appaliquer des pipeline d’analyse sur le cluster decalcul du Genotoul

·     Mettre à jour le GitHub de l’équipe.

Spécificité(s) et environnement du poste

·     Travail sur écran

Profil recherché

Connaissances

·     Connaitre la biologie des sarcomes

·     Connaitre les mécanismes chromosomiques de l’oncogenèse.

·     Maitriser les statistiques adaptées à ce type d’analyse

·     Maitriser le langage R

·     Maitriser le calcule parallélisé sur cluster

Savoir-faire

·     Mener de A à Z un projet d’analyse bioinfomatique

·     Produire des figures de synthèse adaptées aux messages identifiés.

·     Ecrire les articles scientifiques présentant les résultats obtenus.

Aptitudes

·     Rigueur scientifique

·     Esprit critique

·     Esprit d’initiative

Expérience(s) souhaitée(s)

·     Une expérience en  ananlyse bioinformatique de données génomiques tumorales sera appréciée

Niveau de diplôme et formation(s)

·     Bac + 5 Minimum

·     Souhaité dans le domaine de l’oncogenèse