INGÉNIEUR-E BIOLOGISTE EN ANALYSE DE DONNÉES - H/F

Description : Pour ce contrat de travail d'une durée de 2 MOIS RENOUVELABLE, la personne recrutée rejoindra l’équipe « Oncogénèse des sarcomes » dirigée par Frédéric CHIBON. L’équipe cherche à comprendre les mécanismes chromosomiques de l’oncogenèse des sarcomes pléomorphes, caractérisés par une très grande instabilité chromosomique.   Mission principale La personne recrutée aura pour missions : ·     D’analyser les données de variants structuraux identifiés par RNAseq sur les données du TCGA ·     D’Evaluer la pertinence du marqueur biologique iTRAC pour l’analyse pronostique et prédictive de la réponse au traitement systémique dans les différents types de cancers analysés par le TCGA Activités principales ·     Développer et appliquer des scripts R ·     Développer et appaliquer des pipeline d’analyse sur le cluster decalcul du Genotoul ·     Mettre à jour le GitHub de l’équipe. Spécificité(s) et environnement du poste ·     Travail sur écran   Profil recherché : Connaissances ·     Connaitre la biologie des sarcomes ·     Connaitre les mécanismes chromosomiques de l’oncogenèse. ·     Maitriser les statistiques adaptées à ce type d’analyse ·     Maitriser le langage R ·     Maitriser le calcule parallélisé sur cluster Savoir-faire ·     Mener de A à Z un projet d’analyse bioinfomatique ·     Produire des figures de synthèse adaptées aux messages identifiés. ·     Ecrire les articles scientifiques présentant les résultats obtenus. Aptitudes ·     Rigueur scientifique ·     Esprit critique ·     Esprit d’initiative Expérience(s) souhaitée(s) ·     Une expérience en  ananlyse bioinformatique de données génomiques tumorales sera appréciée Niveau de diplôme et formation(s) ·     Bac + 5 Minimum ·     Souhaité dans le domaine de l’oncogenèse