Biostatisticien(ne) (H/F)

Le poste est basé au sein de l'Unité CarMeN (Hôpital Lyon Sud Secteur 2, Bâtiment CENS ELI-2D, 165 Chemin du Grand Revoyet à 69310 PIERRE BENITE) dans l'équipe DO-IT « Diet and food matrix in Obesity: role of the Intestinal tract and innovative Therapeutics ». Au sein du laboratoire, l'équipe DO-IT développe des recherches reconnues au niveau international sur les effets physiologiques et métaboliques des lipides d'origine animale et végétale. Un objectif de l'équipe est de comprendre comment les lipides et bactéries des produits laitiers modulent le microbiote intestinal et ses fonctions métaboliques, dans une perspective de prévention nutritionnelle des désordres métaboliques.

Le projet porte sur l'analyse de données de modèles in vitro et in vivo d'études du microbiote intestinal, des analyses omiques (microbiote, métabolomique, lipidomique) et des données humaines complémentaires.

Missions

Organiser la préparation des données et leur traitement statistique au moyen des outils statistiques et informatiques les mieux adaptés au contexte d'une étude ; élaborer l'enchainement des traitements, du choix des méthodes existantes à l'analyse des résultats et jusqu'à leur diffusion.

Activités principales :

Concevoir et gérer les bases de données de recherche multi-dimensionnelles

Analyser et intégrer des données complexes et hétérogènes issues des plateformes partenaires (séquençage du microbiote 16S, métabolomique / lipidomique ciblée et non ciblée, données physiologiques et métaboliques issues de modèles murins)

Développer et automatiser des pipelines de traitement statistique et bioinformatique (R, Python).

Effectuer des analyses de données multivariées et intégratives (corrélations, PCA, PLS-DA, analyses réseaux) pour relier microbiote - métabolites - phénotypes.

Contribuer à la modélisation des interactions bactéries/lipides/microbiote.

Activités associées :

Rédiger les sections statistiques de rapports et articles scientifiques, ainsi que des synthèses de présentation des résultats des analyses statistiques (français et anglais).